支线任务剧情已经开启契约者可自行选择完成。
1.受人敬仰！：加入一个势力并且声望至少达到尊敬！
2.阿蒙森家族的执着！：在古代遗迹中找到“阿拉伯之泪”！
3.百太郎出场！：救出一文字百太郎！
4.第三类接触：开启火星人声望，并至少达到尊敬！
5.摧毁生物改造室！：至少摧毁三座“生物改造室”！
没错，新的任务世界就是大名鼎鼎的《合金弹头》，零号看着任务栏里的这些任务一时间陷入了沉思，好在此时并没有选择时限这让他有足够的时间在脑中衡量该选择的任务类型。
在脑中对所有任务做了对比和模拟测试后零号便看向了某个主线任务眯起了眼睛，脑子里不由得想起了关于游戏世界中火星人的设定。
合金弹头世界里的火星人在上古时期就造访过地球，很快就将当时地球上的人类奴役并且利用火星人的高科技设备在全世界建造了出了许多宏伟的建筑群。
不过后来不知出于什么原因古代火星人只留下了一小部分人手，其余的的全都离开了地球，一直到摩登将军准备怼翻全世界时期才驾驶着出了故障的太空母舰重新来到地球，并且与摩登军团联盟。
摩登军团答应帮助火星人修理飞船，而作为回报火星人则教授摩登军团远超这个世界的高级科技并与参与推翻正规军的反叛战争。
摩登军团的主基地里就居住着这些火星人，而在火星人到来之后主基地里偶尔会发生一些士兵夜间突然消失的奇怪事件，甚至在一些城市的地铁站内部也会隐隐传出某些非人的嘶吼声。
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